La certificación de origen de productos del sector pesquero e industrial consiste en un proceso en donde exportadores de esos sectores se acogen a beneficios arancelarios siempre que cumplan las reglas de origen establecidas en diversos Acuerdos Comerciales suscritos por Chile.

En el caso de los acuerdos firmados en el marco de la ALADI con Bolivia, Cuba, Ecuador, Mercosur, Perú y Venezuela, la certificación de origen está a cargo del SAG, de SERNAPESCA y de COCHILCO, organismos que cesarán próximamente esta función.